Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CAPSQ13938 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPSQ13938 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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