Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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