Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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