Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms