Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SLAMF1Q13291 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SLAMF1Q13291 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLAMF1Q13291 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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