Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFX1Q12986 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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