Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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