Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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