Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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