Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OC90Q02509 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OC90Q02509 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OC90Q02509 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms