Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYP27A1Q02318 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms