Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms