Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms