Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms