Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
POLR2KP53803 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms