Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNI2P48788 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms