Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV4P43268 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms