Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A2P43004 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms