Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms