Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms