Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms