Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms