Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCAP28676 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms