Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB3P28472 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms