Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms