Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPREP23469 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPREP23469 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPREP23469 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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