Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms