Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP4AP20648 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms