Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms