Protein–RNA interactions for Protein: P13671

C6, Complement component C6, humanhuman

Predictions only

Length 934 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6P13671 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6P13671 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6P13671 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C6P13671 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms