Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms