Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms