Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms