Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALUO43852 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALUO43852 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms