Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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