Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBDO15205 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms