Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CEP290O15078 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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