Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms