Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP17L12C9JPN9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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