Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms