Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms