Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms