Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF6Q9Y4K3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms