Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC12A4Q9UP95 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms