Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms