Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms