Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CPNE7Q9UBL6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CPNE7Q9UBL6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CPNE7Q9UBL6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CPNE7Q9UBL6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CPNE7Q9UBL6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CPNE7Q9UBL6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CPNE7Q9UBL6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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