Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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