Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms