Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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